商標注冊失敗后，商標代理機構是否有責任需要具體情況具體分析。

一般來說，如果商標代理機構在服務過程中存在以下情況，可能需要承擔一定的責任：

未履行充分的告知義務：沒有向申請人明確說明商標注冊存在的風險，或者對申請人提供的商標沒有進行充分的近似查詢和分析，導致申請人在不知情的情況下提交了難以注冊成功的商標。

工作失誤：例如在申請材料的準備、提交過程中出現(xiàn)錯誤，或者遺漏了重要的信息。

違反合同約定：如果代理機構違反了與申請人簽訂的服務合同中的相關條款。

然而，如果商標代理機構已經按照行業(yè)規(guī)范和合同約定履行了應盡的職責，包括進行充分的查詢、提供合理的建議、準確無誤地準備和提交申請材料等，商標注冊仍然失敗，那么代理機構通常不承擔責任。

因為商標注冊能否成功受到多種因素的影響，例如商標的顯著性、是否與在先商標構成近似、商標審查員的主觀判斷等，這些都是代理機構難以完全控制的。

例如，某商標代理機構在接受委托后，沒有認真查詢商標近似情況，導致申請人提交的商標因與已有商標近似而被駁回，這種情況下代理機構就有責任。果代理機構已經進行了充分查詢和提醒，而商標因其他不可預見的原因被駁回，代理機構可能就沒有責任。